在广东、天津、福建自贸区挂牌一周年以及上海自贸区扩区一周年之际，中山大学自贸区综合研究院发布《中国自由贸易试验区发展蓝皮书（2015-2016）》，显示四大自贸试验区在整体有序推进中，制度创新指数突出，在政府职能转变、投资、贸易、金融等多个领域初步形成了可复制可推广的经验。
中国自贸区是新时期深化改革和扩大开放的“试验田”，以制度创新为核心任务。通过编制“2015-2016年中国自贸试验区制度创新指数”，研究人员对四大自贸试验区（8大片区）的制度创新成效开展了评价。研究选取“贸易便利化”、“金融管理与制度创新”、“投资管理体制改革”及“政府职能转变”4个一级指标和14个二级指标、42个三级指标展开，收集汇总分析政府政策汇编、制度创新成效汇编、官网与主流媒体报道、研究机构共享数据和实地调研数据，从而测算出8大片区的制度创新指数，反映了不同片区制度创新的程度和效能。从总体上看，上海自贸区由于开展试验时间较长，指数最高，为80.15；而深圳前海片区得益于其城市的创新活力，制度创新指数也高达78.57。自贸区先行先试战略总体上获得了成功。
此外，各片区在具体领域也各具优势，呈现鲜明的特色。例如，珠海横琴片区尽管总体指数仍有较大的增长空间，但为内地首个获准赴香港发行地方城投类企业债券的自贸区，厦门片区的跨海峡人民币代理清算群和保税展示交易内销货物电子化“分段担保”也优势明显。
中山大学副校长、自贸区综合研究院院长李善民表示，编制制度创新指数，一方面能够从宏观层面对8大自贸片区的总体改革情况进行持续的把握，另一方面则从四大创新方向的微观层面，能够洞悉8大自贸片区各自的改革创新优势和需要进一步完善和深化的制度创新领域，从而指导自贸区改革创新实践向“更开放、更市场、更便捷”的高标准迈进，积极应对国际投资与贸易规则变化带来的深刻影响和挑战。
蓝皮书还对四大自贸区下一阶段的改革方向提出建议：上海将重点探索浦东新区作为一级地方政府全方位转变职能，积极探索审批、监管、执法的适当分离等制度创新；广东自贸试验区继续在推动国际化、法治化和便利化营商环境建设、建设“21世纪海上丝绸之路”战略枢纽、深化粤港澳合作等领域进行改革；天津应把服务“一带一路”与京津冀协同发展战略的举措落到实处，发挥开放区域联动效应，以自贸区为核心区逐步实行“境内关外”海关监管模式；福建应积极推进与“海丝”沿线国家贸易投资自由化，加强闽台两地经济合作，推动闽台跨境金融业务突破等领域不断取得进展。
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